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間違えたとき、どう動く？修正申告・更正の請求の違い

2026.02.16 2026.02.20

こんにちは、しんこう会計事務所の新美です。

確定申告、出しちゃった後にミスを見つける。
これ、税理士にとっても心臓に悪い瞬間です。
でも安心してください。
税務の世界には、
ちゃんと「後出しのルール」も用意されています。
今日は、間違いに気づいたときに使う手続き
「修正申告」「更正の請求」「還付申告」を、
期限と実例で整理します。
個人がメインですが法人もサラッと。

まず結論。方向が逆、そして分岐は3つ

ここを押さえると迷いません。
税額が増えるなら修正申告。
税額が減るなら、
申告を出している場合は更正の請求。
そもそも申告を出していないなら還付申告。
「税金が戻る＝更正の請求」と思いがちですが、
実務ではここが一番の落とし穴です。
分かれ目は、確定申告を出しているかどうか。

修正申告：税金が増えるとき（放置が一番損）

修正申告は、
税金が本来より少なかったときに直す手続きです。
売上の計上漏れ、
経費の過大計上、
減価償却の計算ミス、
消費税区分ミスなど。
個人でも法人でも起きます。
期限としては「気づいたらすぐ」
が実務の結論ですが、
厳密には更正できる期間があります。
一般には原則5年、一定の場合は7年
という整理で覚えておくのが安全です。
なので「期限はない」と言い切るより、
こう考えるのが現実的。
そして大事なのは、期限うんぬん以前に、
放置すると延滞税が増えていくこと。
遅くなるほど、コストが積み上がります。

延滞税・加算税の差

延滞税は、遅れた期間に応じて増えるコスト。
加算税は、
状況によって追加される罰金的なものです。
税務署に指摘されてから動くと、
加算税が10%〜15%上乗せになる
場面もあります。
自分から動けば、
0%（または5%）で済むこともある。
この差はキャッシュに直撃します。

更正の請求：税額が減るとき（還付だけじゃない）

更正の請求は、確定申告を出した後に
「内容を訂正したい」ときの手続きです。
経費の入れ忘れ、
控除の適用漏れ、
税額計算のミス
などで、結果として還付になることが多い。
ただ、ここは誤解が多いので一言。
更正の請求は
「税金を払っている人だけの制度」ではありません。
たとえば赤字でもあり得ます。
過去の赤字を繰り越す制度があるので、
更正の請求によって
「繰り越せる赤字（欠損金）が増える／減る」
という論点も出ます。
つまり、還付が出るときだけの手続きではない
ということです。
また、更正の請求の期限は、
原則として法定申告期限から5年。
個人も法人も同じです。
個人の例：2020年分（法定申告期限2021/3/15）
→2026/3/15まで
法人の例：3月決算の2021/3期（申告期限2021/5/31）
→2026/5/31まで

税務署の空気感：ここは「準備の覚悟」を持つ

更正の請求は、
いわば国に「お金を返して」と言う手続きです。
当然、税務署も「はい、どうぞ」とはなりません。
修正申告よりも、証拠の整合性を見られる覚悟で
準備するのが正解です。
還付の場合は、
帳簿や取引資料の
確認を求められることもあります。
ただ、勘違いしないでほしいのはここ。
更正の請求は正式な手続きです。
資料を揃えて筋が通っているなら、
堂々とやって問題ありません。

還付申告：申告していない人の「5年という猶予」

ここも超よくある。
給与所得のみで年末調整が完結していて、　確定申告をしていない。
その後に生命保険料控除証明や、
住宅ローン控除の書類が出てきた。
この場合、税金が戻る可能性はありますが、
手続きは更正の請求ではありません。
申告書を出していないので「訂正」ではなく、
新たに確定申告を出す（＝還付申告）になります。
そして還付申告の強いところは、
原則として5年前まで遡れること。
「期限過ぎたかも」と諦めている人が結構いますが、
実は還付できる権利が残っていることがあります。
年金でも同じです。
申告していなかったけど、
申告すれば源泉徴収されていた
税が戻ると分かった。
これも更正の請求ではなく、還付申告の話。
5年遡れる可能性があります。

よくある相談：住宅ローン控除とふるさと納税

住宅ローン控除の入れ忘れは本当に多いです。
確定申告を出しているなら更正の請求。
年末調整のみで申告していないなら還付申告。
ふるさと納税も同じ。
ワンストップ特例のつもりが、
医療費控除などで確定申告をした。
その際にふるさと納税を入れ忘れた。
このケースは「申告は出している」ので、
基本は更正の請求。
期限は5年です。

損しないための“使える制度”です

税金は、払いすぎても国は教えてくれません。
でも、足りなければきっちり取りに来ます。
だからこそ、間違いに気づいたときに
「正しく動ける」ことが大事です。
修正申告と更正の請求は方向が逆。
そして還付申告には5年という時間軸があります。
「もう遅いかな」と諦める前に、
まずは期限をカレンダーで確認してみてください。